吴秉铨教授先后8年就读上海复旦大学医学院和北京大学医学院，毕业后继续攻读医学院病理学研究生4年。在医学院历任助教、讲师、副教授、教授、博士生导师、病理学系主任，基础医学院院长工作。

    在50年病理工作中，前20年致力于诊断病理学和实验肿瘤学，后30年从事癌转移生物学和分子病理学。吴秉铨教授曾留学美国，在美国国家卫生研究院癌研究所进修，并曾担任美国加州Loma Linda大学医学中心病理系客座教授。在癌转移研究上曾连续获得三次国家重点攻关课题项目，历时15年。在国际上获得三项纽约中华医学基金项目和一项联合国工业发展组织遗传和生物工程研究项目，发表论著百余篇。

    曾担任北京医科大学学术委员会副主任委员，学位委员会副主席，两届国家教委科学技术委员会委员，卫生部学位委员会委员，国务院学位委员会基础医学学科评议组成员和召集人之一，中华医学会北京病理学会主任委员，中华医学会病理分会副主任委员，亚洲、太平洋地区病理学会联合会副主席、主席（APASP）。曾兼任国内几所大学,北京大学生命科学院、汕头大学医学院、第一军医大学、第二军医大学、第四军医大学肿瘤研究所、天津医科大学肿瘤研究所的兼职或客座教授，国内外几种杂志, 中华医学杂志、中华肿瘤学杂志，临床与实验病理学杂志，Human  Pathology杂志（美国），Acta Pathologica,   Microbiologica et Immunologica Scandinavica 杂志（丹麦），现任北京大学医学部病理学系教授、国际病理学会(IAP)中国部主席、中华病理学杂志名誉总编、中华医学会医疗事故技术鉴定专家。 中国癌症杂志、实用肿瘤学杂志，诊断病理学杂志,  诊断学理论与实践杂志, 国际病理科学.与临床杂志, Pathology  International 杂志（日本）, Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 杂志(意大利)的编委和顾问。.曾应邀赴美、亚、欧、澳２０余国家学术交流和讲学。2004年香港医学科学院病理学院授予吴秉铨教授荣誉院士。